rdkit.ML.Cluster package

Submodules

• rdkit.ML.Cluster.Butina module
  • ClusterData()
  • EuclideanDist()
  • compute_distance_matrix()
• rdkit.ML.Cluster.ClusterUtils module
  • FindClusterCentroidFromDists()
  • GetNodeList()
  • GetNodesDownToCentroids()
  • SplitIntoNClusters()
• rdkit.ML.Cluster.ClusterVis module
  • ClusterRenderer
    • ClusterRenderer.DrawTree()
  • ClusterToImg()
  • ClusterToPDF()
  • ClusterToSVG()
  • DrawClusterTree()
  • VisOpts
    • VisOpts.hideColor
    • VisOpts.hideWidth
    • VisOpts.highlightColor
    • VisOpts.highlightRad
    • VisOpts.lineColor
    • VisOpts.lineWidth
    • VisOpts.nodeColor
    • VisOpts.nodeRad
    • VisOpts.terminalColors
    • VisOpts.xOffset
    • VisOpts.yOffset
• rdkit.ML.Cluster.Clusters module
  • Cluster
    • Cluster.AddChild()
    • Cluster.AddChildren()
    • Cluster.Compare()
    • Cluster.FindSubtree()
    • Cluster.GetChildren()
    • Cluster.GetData()
    • Cluster.GetIndex()
    • Cluster.GetMetric()
    • Cluster.GetName()
    • Cluster.GetPoints()
    • Cluster.GetPointsPositions()
    • Cluster.GetPosition()
    • Cluster.IsTerminal()
    • Cluster.Print()
    • Cluster.RemoveChild()
    • Cluster.SetData()
    • Cluster.SetIndex()
    • Cluster.SetMetric()
    • Cluster.SetName()
    • Cluster.SetPosition()
  • cmp()
• rdkit.ML.Cluster.Murtagh module
  • ClusterData()
• rdkit.ML.Cluster.Resemblance module
  • CalcMetricMatrix()
  • EuclideanDistance()
  • FindMinValInList()
  • ShowMetricMat()
• rdkit.ML.Cluster.Standardize module
  • StdDev()
• rdkit.ML.Cluster.Clustering module
  • MurtaghCluster()
  • MurtaghDistCluster()

Module contents