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RDKit
Open-source cheminformatics and machine learning.
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#include <RDGeneral/RDExportMacros.h>Go to the source code of this file.
| #define RDKIT_ABBREVIATIONS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 9 of file export.h.
Referenced by RDKit::Abbreviations::applyMatches(), RDKit::Abbreviations::condenseAbbreviationSubstanceGroups(), RDKit::Abbreviations::condenseMolAbbreviations(), RDKit::Abbreviations::Utils::getDefaultAbbreviations(), RDKit::Abbreviations::Utils::getDefaultLinkers(), RDKit::Abbreviations::labelMatches(), and RDKit::Abbreviations::labelMolAbbreviations().
| #define RDKIT_ALIGNMENT_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_AVALON_CLIB_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_AVALONLIB_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_CATALOGS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_CHEMDRAW_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_CHEMICALFEATURES_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_CHEMREACTIONS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 57 of file export.h.
Referenced by RDKit::addChemicalReactionToPNGStream(), RDKit::addRecursiveQueriesToReaction(), RDKit::RxnOps::adjustTemplates(), RDKit::CDXMLFileToChemicalReactions(), RDKit::CDXMLToChemicalReactions(), RDKit::ChemicalReactionToCXRxnSmarts(), RDKit::ChemicalReactionToCXRxnSmiles(), RDKit::ChemicalReactionToRxnBlock(), RDKit::ChemicalReactionToRxnMol(), RDKit::ChemicalReactionToRxnSmarts(), RDKit::ChemicalReactionToRxnSmiles(), RDKit::ChemicalReactionToV3KRxnBlock(), RDDepict::compute2DCoordsForReaction(), RDKit::computeNumProducts(), RDKit::EnumerateLibraryCanSerialize(), RDKit::RxnOps::fixAtomMaps(), RDKit::RxnOps::fixHs(), RDKit::RxnOps::fixRGroups(), RDKit::EnumerationStrategyPickler::fromPickle(), RDKit::ReactionRunnerUtils::generateOneProductSet(), RDKit::getEndIterator(), RDKit::getSizesFromReactants(), RDKit::getStartIterator(), RDKit::hasAgentTemplateSubstructMatch(), RDKit::hasProductTemplateSubstructMatch(), RDKit::hasReactantTemplateSubstructMatch(), RDKit::hasReactionAtomMapping(), RDKit::hasReactionSubstructMatch(), RDKit::isMoleculeAgentOfReaction(), RDKit::isMoleculeAgentOfReaction(), RDKit::isMoleculeProductOfReaction(), RDKit::isMoleculeProductOfReaction(), RDKit::isMoleculeProductOfReaction(), RDKit::isMoleculeReactantOfReaction(), RDKit::isMoleculeReactantOfReaction(), RDKit::isMoleculeReactantOfReaction(), RDKit::isReactionTemplateMoleculeAgent(), RDKit::EnumerationStrategyPickler::pickle(), RDKit::EnumerationStrategyPickler::pickle(), RDKit::preprocessReaction(), RDKit::preprocessReaction(), RDKit::preprocessReaction(), RDKit::preprocessReaction(), RDKit::v2::ReactionParser::ReactionFromRxnBlock(), RDKit::v2::ReactionParser::ReactionFromRxnFile(), RDKit::v2::ReactionParser::ReactionFromSmarts(), RDKit::v2::ReactionParser::ReactionFromSmiles(), RDKit::reduceProductToSideChains(), RDKit::removeMappingNumbersFromReactions(), RDKit::removeNonmatchingReagents(), RDKit::run_Reactant(), RDKit::run_Reactant(), RDKit::run_Reactants(), RDKit::RxnMolToChemicalReaction(), RDKit::RxnOps::sanitizeRxn(), RDKit::RxnOps::sanitizeRxn(), RDKit::RxnOps::sanitizeRxnAsMols(), RDKit::StructuralFingerprintChemReaction(), and RDKit::updateProductsStereochem().
| #define RDKIT_CHEMTRANSFORMS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 65 of file export.h.
Referenced by RDKit::addRecursiveQueries(), RDKit::combineMols(), RDKit::MolFragmenter::constructBRICSAtomTypes(), RDKit::MolFragmenter::constructBRICSBondTypes(), RDKit::MolFragmenter::constructFragmenterAtomTypes(), RDKit::MolFragmenter::constructFragmenterAtomTypes(), RDKit::MolFragmenter::constructFragmenterBondTypes(), RDKit::MolFragmenter::constructFragmenterBondTypes(), RDKit::details::copyStereoGroups(), RDKit::deleteSubstructs(), RDKit::MolFragmenter::fragmentOnBonds(), RDKit::MolFragmenter::fragmentOnBonds(), RDKit::MolFragmenter::fragmentOnBRICSBonds(), RDKit::MolFragmenter::fragmentOnSomeBonds(), RDKit::molzip(), RDKit::molzip(), RDKit::molzip(), RDKit::molzip(), RDKit::MurckoDecompose(), RDKit::parseMolzipParametersJSON(), RDKit::parseQueryDefFile(), RDKit::parseQueryDefFile(), RDKit::parseQueryDefText(), RDKit::replaceCore(), RDKit::replaceCore(), RDKit::replaceSidechains(), RDKit::replaceSubstructs(), and RDKit::details::updateSubMolConfs().
| #define RDKIT_CIPLABELER_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 33 of file export.h.
Referenced by RDKit::CIPLabeler::assignCIPLabels(), RDKit::CIPLabeler::assignCIPLabels(), and RDKit::CIPLabeler_detail::decrementRemainingCallCountAndCheck().
| #define RDKIT_CONFORMERPARSER_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_COORDGEN_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_DATASTRUCTS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 89 of file export.h.
Referenced by AllBitSimilarity(), AllProbeBitsMatch(), AllProbeBitsMatch(), AllProbeBitsMatch(), AllProbeBitsMatch(), AllProbeBitsMatch(), AsymmetricSimilarity(), Base64Decode(), Base64Encode(), Base64Encode(), BitVectToBinaryText(), BitVectToFPSText(), BitVectToText(), BraunBlanquetSimilarity(), CalcBitmapAllProbeBitsMatch(), CalcBitmapDice(), CalcBitmapPopcount(), CalcBitmapTanimoto(), CalcBitmapTversky(), RDKit::computeL1Norm(), RDKit::computeL1Norm(), convertToExplicit(), CosineSimilarity(), DiceSimilarity(), FoldFingerprint(), FromBitString(), FromDaylightString(), KulczynskiSimilarity(), McConnaugheySimilarity(), NumBitsInCommon(), NumBitsInCommon(), NumOnBitsInCommon(), NumOnBitsInCommon(), OffBitProjSimilarity(), OffBitsInCommon(), OnBitProjSimilarity(), OnBitSimilarity(), OnBitsInCommon(), RDKit::operator&(), RDKit::operator+(), RDKit::operator+(), RDKit::operator-(), RDKit::operator|(), RogotGoldbergSimilarity(), RusselSimilarity(), SokalSimilarity(), TanimotoSimilarity(), TverskySimilarity(), UpdateBitVectFromBinaryText(), and UpdateBitVectFromFPSText().
| #define RDKIT_DEPICTOR_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 97 of file export.h.
Referenced by RDDepict::compute2DCoords(), RDDepict::compute2DCoords(), RDDepict::compute2DCoordsMimicDistMat(), RDDepict::computeBisectPoint(), RDDepict::embedRing(), RDDepict::findBondsPairsToPermuteDeg4(), RDDepict::findCoreRings(), RDDepict::findNextRingToEmbed(), RDDepict::generateDepictionMatching2DStructure(), RDDepict::generateDepictionMatching2DStructure(), RDDepict::generateDepictionMatching2DStructure(), RDDepict::generateDepictionMatching2DStructure(), RDDepict::generateDepictionMatching3DStructure(), RDDepict::getAllRotatableBonds(), RDDepict::getNbrAtomAndBondIds(), RDDepict::getRotatableBonds(), RDDepict::hasTerminalRGroupOrQueryHydrogen(), RDDepict::invertWedgingIfMolHasFlipped(), RDDepict::loadDefaultRingSystemTemplates(), RDDepict::normalizeDepiction(), RDDepict::pickFirstRingToEmbed(), RDDepict::prepareTemplateForRGroups(), RDDepict::rankAtomsByRank(), RDDepict::reducedToFullMatches(), RDDepict::reflectPoint(), RDDepict::reflectPoints(), RDDepict::setNbrOrder(), RDDepict::setRingSystemTemplates(), RDDepict::straightenDepiction(), RDDepict::transformPoints(), and RDDepict::DepictException::~DepictException().
| #define RDKIT_DEPROTECT_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 105 of file export.h.
Referenced by RDKit::Deprotect::deprotect(), RDKit::Deprotect::deprotectInPlace(), and RDKit::Deprotect::getDeprotections().
| #define RDKIT_DESCRIPTORS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 113 of file export.h.
Referenced by RDKit::Descriptors::AtomFeatVect(), RDKit::Descriptors::AUTOCORR2D(), RDKit::Descriptors::calcAMW(), RDKit::Descriptors::calcChi0n(), RDKit::Descriptors::calcChi0v(), RDKit::Descriptors::calcChi1n(), RDKit::Descriptors::calcChi1v(), RDKit::Descriptors::calcChi2n(), RDKit::Descriptors::calcChi2v(), RDKit::Descriptors::calcChi3n(), RDKit::Descriptors::calcChi3v(), RDKit::Descriptors::calcChi4n(), RDKit::Descriptors::calcChi4v(), RDKit::Descriptors::calcChiNn(), RDKit::Descriptors::calcChiNv(), RDKit::Descriptors::calcClogP(), RDKit::Descriptors::calcCrippenDescriptors(), RDKit::Descriptors::calcCustomProp_VSA(), RDKit::Descriptors::calcExactMW(), RDKit::Descriptors::calcFractionCSP3(), RDKit::Descriptors::calcHallKierAlpha(), RDKit::Descriptors::calcKappa1(), RDKit::Descriptors::calcKappa2(), RDKit::Descriptors::calcKappa3(), RDKit::Descriptors::calcLabuteASA(), RDKit::Descriptors::calcLipinskiHBA(), RDKit::Descriptors::calcLipinskiHBD(), RDKit::Descriptors::calcMolFormula(), RDKit::Descriptors::calcMQNs(), RDKit::Descriptors::calcMR(), RDKit::Descriptors::calcNumAliphaticCarbocycles(), RDKit::Descriptors::calcNumAliphaticHeterocycles(), RDKit::Descriptors::calcNumAliphaticRings(), RDKit::Descriptors::calcNumAmideBonds(), RDKit::Descriptors::calcNumAromaticCarbocycles(), RDKit::Descriptors::calcNumAromaticHeterocycles(), RDKit::Descriptors::calcNumAromaticRings(), RDKit::Descriptors::calcNumAtoms(), RDKit::Descriptors::calcNumBridgeheadAtoms(), RDKit::Descriptors::calcNumHBA(), RDKit::Descriptors::calcNumHBD(), RDKit::Descriptors::calcNumHeavyAtoms(), RDKit::Descriptors::calcNumHeteroatoms(), RDKit::Descriptors::calcNumHeterocycles(), RDKit::Descriptors::calcNumRings(), RDKit::Descriptors::calcNumRotatableBonds(), RDKit::Descriptors::calcNumRotatableBonds(), RDKit::Descriptors::calcNumSaturatedCarbocycles(), RDKit::Descriptors::calcNumSaturatedHeterocycles(), RDKit::Descriptors::calcNumSaturatedRings(), RDKit::Descriptors::calcNumSpiroAtoms(), RDKit::Descriptors::calcOxidationNumbers(), RDKit::Descriptors::calcPEOE_VSA(), RDKit::Descriptors::calcPhi(), RDKit::Descriptors::calcSlogP_VSA(), RDKit::Descriptors::calcSMR_VSA(), RDKit::Descriptors::calcTPSA(), RDKit::Descriptors::calcUSRDistributions(), RDKit::Descriptors::calcUSRDistributionsFromPoints(), RDKit::Descriptors::calcUSRFromDistributions(), RDKit::Descriptors::calcUSRScore(), RDKit::Descriptors::getCrippenAtomContribs(), RDKit::Descriptors::getLabuteAtomContribs(), RDKit::Descriptors::getTPSAAtomContribs(), RDKit::Descriptors::detail::hkDeltas(), RDKit::Descriptors::makePropertyRangeQuery(), RDKit::Descriptors::numAtomStereoCenters(), RDKit::Descriptors::numUnspecifiedAtomStereoCenters(), RDKit::Descriptors::registerDescriptors(), RDKit::Descriptors::USR(), and RDKit::Descriptors::USRCAT().
| #define RDKIT_DETERMINEBONDS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 121 of file export.h.
Referenced by RDKit::determineBondOrders(), RDKit::determineBonds(), and RDKit::determineConnectivity().
| #define RDKIT_DISTGEOMETRY_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 137 of file export.h.
Referenced by DistGeom::calcChiralVolume(), DistGeom::calcChiralVolume(), DistGeom::computeInitialCoords(), DistGeom::computeInitialCoords(), DistGeom::computeRandomCoords(), DistGeom::computeRandomCoords(), DistGeom::construct3DForceField(), DistGeom::construct3DForceField(), DistGeom::constructForceField(), DistGeom::constructPlain3DForceField(), DistGeom::pickRandomDistMat(), DistGeom::pickRandomDistMat(), DistGeom::triangleSmoothBounds(), and DistGeom::triangleSmoothBounds().
| #define RDKIT_DISTGEOMHELPERS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 129 of file export.h.
Referenced by RDKit::DGeomHelpers::collectBondsAndAngles(), RDKit::DGeomHelpers::EmbedMultipleConfs(), RDKit::DGeomHelpers::embedParametersToJSON(), RDKit::DGeomHelpers::initBoundsMat(), RDKit::DGeomHelpers::initBoundsMat(), RDKit::DGeomHelpers::setTopolBounds(), RDKit::DGeomHelpers::setTopolBounds(), and RDKit::DGeomHelpers::updateEmbedParametersFromJSON().
| #define RDKIT_EHTLIB_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_EIGENSOLVERS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 153 of file export.h.
Referenced by RDNumeric::EigenSolvers::powerEigenSolver().
| #define RDKIT_ENUMERATESTEREOISOMERS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_FILEPARSERS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 177 of file export.h.
Referenced by RDKit::addMetadataToPNGStream(), RDKit::addMolToPNGStream(), RDKit::addWavyBondsForStereoAny(), RDKit::clearMolBlockWedgingInfo(), RDKit::ClearSingleBondDirFlags(), RDKit::ConnectTheDots(), RDKit::DetectAtomStereoChemistry(), RDKit::DetectBondStereoChemistry(), RDKit::DetermineBondWedgeState(), RDKit::DetermineBondWedgeState(), RDKit::FASTAToMol(), RDKit::FASTAToMol(), RDKit::FASTAToMol(), RDKit::FASTAToMol(), RDKit::FileParserUtils::finishMolProcessing(), RDKit::FileParserUtils::getV3000CTAB(), RDKit::FileParserUtils::getV3000Line(), RDKit::v2::CDXMLParser::hasChemDrawCDXSupport(), RDKit::HELMToMol(), RDKit::HELMToMol(), RDKit::invertMolBlockWedgingInfo(), RDKit::IsBlacklistedPair(), RDKit::markUnspecifiedStereoAsUnknown(), RDKit::v2::FileParsers::MolFromMol2Block(), RDKit::v2::FileParsers::MolFromMol2DataStream(), RDKit::v2::FileParsers::MolFromMol2File(), RDKit::v2::FileParsers::MolFromMolBlock(), RDKit::v2::FileParsers::MolFromMolDataStream(), RDKit::v2::FileParsers::MolFromMolFile(), RDKit::v2::FileParsers::MolFromPDBBlock(), RDKit::v2::FileParsers::MolFromPDBDataStream(), RDKit::v2::FileParsers::MolFromPDBFile(), RDKit::v2::FileParsers::MolFromSCSRBlock(), RDKit::v2::FileParsers::MolFromSCSRDataStream(), RDKit::v2::FileParsers::MolFromSCSRFile(), RDKit::v2::FileParsers::MolFromTPLDataStream(), RDKit::v2::FileParsers::MolFromTPLFile(), RDKit::v2::FileParsers::MolFromXYZBlock(), RDKit::v2::FileParsers::MolFromXYZDataStream(), RDKit::v2::FileParsers::MolFromXYZFile(), RDKit::v2::CDXMLParser::MolsFromCDXML(), RDKit::v2::CDXMLParser::MolsFromCDXMLFile(), RDKit::MolToCMLBlock(), RDKit::MolToCMLFile(), RDKit::MolToFASTA(), RDKit::MolToHELM(), RDKit::MolToMolBlock(), RDKit::MolToMolFile(), RDKit::MolToPDBBlock(), RDKit::MolToPDBFile(), RDKit::MolToSequence(), RDKit::MolToTPLFile(), RDKit::MolToTPLText(), RDKit::MolToV2KMolBlock(), RDKit::MolToXYZBlock(), RDKit::MolToXYZFile(), RDKit::FileParserUtils::moveAdditionalPropertiesToSGroups(), RDKit::FileParserUtils::ParseV2000CTAB(), RDKit::SGroupParsing::ParseV3000Array(), RDKit::FileParserUtils::ParseV3000CTAB(), RDKit::PNGStreamToMol(), RDKit::PNGStreamToMols(), RDKit::RDKitSVGToMol(), RDKit::RDKitSVGToMol(), RDKit::reapplyMolBlockWedging(), RDKit::FileParserUtils::replaceAtomWithQueryAtom(), RDKit::SamePDBResidue(), RDKit::SequenceToMol(), RDKit::SequenceToMol(), RDKit::SequenceToMol(), RDKit::SequenceToMol(), RDKit::StandardPDBResidueBondOrders(), RDKit::FileParserUtils::strip(), RDKit::strip(), RDKit::FileParserUtils::toDouble(), RDKit::FileParserUtils::toDouble(), RDKit::FileParserUtils::toInt(), RDKit::FileParserUtils::toInt(), RDKit::FileParserUtils::toUnsigned(), RDKit::FileParserUtils::toUnsigned(), RDKit::translateChiralFlagToStereoGroups(), RDKit::WedgeBond(), and RDKit::WedgeMolBonds().
| #define RDKIT_FILTERCATALOG_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 185 of file export.h.
Referenced by RDKit::FilterCatalogCanSerialize(), and RDKit::GetFunctionalGroupHierarchy().
| #define RDKIT_FINGERPRINTS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 193 of file export.h.
Referenced by RDKit::RDKitFPUtils::buildDefaultRDKitFingerprintAtomInvariants(), RDKit::RDKitFPUtils::enumerateAllPaths(), RDKit::RDKitFPUtils::generateBondHashes(), RDKit::generatorFromJSON(), RDKit::generatorToJSON(), RDKit::AtomPairs::getAtomCode(), RDKit::AtomPairs::getAtomPairCode(), RDKit::AtomPairs::getAtomPairFingerprint(), RDKit::AtomPairs::getAtomPairFingerprint(), RDKit::MorganFingerprints::getConnectivityInvariants(), RDKit::getCountFP(), RDKit::MorganFingerprints::getFeatureInvariants(), RDKit::MorganFingerprints::getFingerprint(), RDKit::MACCSFingerprints::getFingerprintAsBitVect(), RDKit::MorganFingerprints::getFingerprintAsBitVect(), RDKit::getFP(), RDKit::getFPBulk(), RDKit::AtomPairs::getHashedAtomPairFingerprint(), RDKit::AtomPairs::getHashedAtomPairFingerprintAsBitVect(), RDKit::MorganFingerprints::getHashedFingerprint(), RDKit::AtomPairs::getHashedTopologicalTorsionFingerprint(), RDKit::MorganFingerprint::getMorganGenerator(), RDKit::MorganFingerprint::getMorganGenerator(), RDKit::RDKitFP::getRDKitFPGenerator(), RDKit::RDKitFP::getRDKitFPGenerator(), RDKit::getSparseCountFP(), RDKit::getSparseFP(), RDKit::getSparseFPBulk(), RDKit::AtomPairs::getTopologicalTorsionCode(), RDKit::AtomPairs::getTopologicalTorsionFingerprint(), RDKit::AtomPairs::getTopologicalTorsionHash(), RDKit::RDKitFPUtils::identifyQueryBonds(), RDKit::LayeredFingerprintMol(), RDKit::PatternFingerprintMol(), RDKit::PatternFingerprintMol(), and RDKit::RDKFingerprintMol().
| #define RDKIT_FMCS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 169 of file export.h.
Referenced by RDKit::checkAtomCharge(), RDKit::checkAtomChirality(), RDKit::checkAtomDistance(), RDKit::checkAtomRingMatch(), RDKit::checkBondRingMatch(), RDKit::checkBondStereo(), RDKit::findMCS(), RDKit::findMCS(), RDKit::findMCS(), RDKit::findMCS_P(), RDKit::havePairOfCompatibleRings(), RDKit::MCSAtomCompareAny(), RDKit::MCSAtomCompareAnyHeavyAtom(), RDKit::MCSAtomCompareElements(), RDKit::MCSAtomCompareIsotopes(), RDKit::MCSBondCompareAny(), RDKit::MCSBondCompareOrder(), RDKit::MCSBondCompareOrderExact(), RDKit::MCSProgressCallbackTimeout(), RDKit::parseMCSParametersJSON(), RDKit::FMCS::SubstructMatchCustom(), and RDKit::FMCS::SubstructMatchCustomTable().
| #define RDKIT_FORCEFIELD_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 201 of file export.h.
Referenced by ForceFields::MMFF::Utils::calcAngleBendEnergy(), ForceFields::MMFF::Utils::calcAngleBendGrad(), ForceFields::UFF::Utils::calcAngleBendGrad(), ForceFields::MMFF::Utils::calcAngleForceConstant(), ForceFields::UFF::Utils::calcAngleForceConstant(), ForceFields::MMFF::Utils::calcAngleRestValue(), ForceFields::MMFF::Utils::calcBondForceConstant(), ForceFields::UFF::Utils::calcBondForceConstant(), ForceFields::MMFF::Utils::calcBondRestLength(), ForceFields::UFF::Utils::calcBondRestLength(), ForceFields::MMFF::Utils::calcBondStretchEnergy(), ForceFields::MMFF::Utils::calcCosTheta(), ForceFields::MMFF::Utils::calcEleEnergy(), ForceFields::UFF::Utils::calcNonbondedDepth(), ForceFields::UFF::Utils::calcNonbondedMinimum(), ForceFields::MMFF::Utils::calcOopBendEnergy(), ForceFields::MMFF::Utils::calcOopBendForceConstant(), ForceFields::MMFF::Utils::calcOopChi(), ForceFields::MMFF::Utils::calcStbnForceConstants(), ForceFields::MMFF::Utils::calcStretchBendEnergy(), ForceFields::MMFF::Utils::calcTorsionCosPhi(), ForceFields::MMFF::Utils::calcTorsionEnergy(), ForceFields::MMFF::Utils::calcTorsionGrad(), ForceFields::UFF::Utils::calcTorsionGrad(), ForceFields::UFF::Utils::calculateCosTorsion(), ForceFields::UFF::Utils::calculateCosY(), ForceFields::MMFF::Utils::calcUnscaledVdWMinimum(), ForceFields::MMFF::Utils::calcUnscaledVdWWellDepth(), ForceFields::MMFF::Utils::calcVdWEnergy(), RDKit::ForceFieldsHelper::computeDihedral(), RDKit::ForceFieldsHelper::computeDihedral(), ForceFields::UFF::Utils::equation17(), ForceFields::UFF::Utils::isInGroup6(), RDKit::ForceFieldsHelper::normalizeAngleDeg(), and ForceFields::MMFF::Utils::scaleVdWParams().
| #define RDKIT_FORCEFIELDHELPERS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 209 of file export.h.
Referenced by RDKit::MMFF::Tools::addAngles(), RDKit::UFF::Tools::addAngles(), RDKit::UFF::Tools::addAtomChargeFlags(), RDKit::MMFF::Tools::addBonds(), RDKit::UFF::Tools::addBonds(), RDKit::MMFF::Tools::addEle(), RDKit::UFF::Tools::addInversions(), RDKit::UFF::Tools::addNonbonded(), RDKit::MMFF::Tools::addOop(), RDKit::MMFF::Tools::addStretchBend(), RDKit::MMFF::Tools::addTorsions(), RDKit::UFF::Tools::addTorsions(), RDKit::MMFF::Tools::addVdW(), RDKit::MMFF::areAtomsInSameAromaticRing(), RDKit::MMFF::areAtomsInSameRingOfSize(), ForceFields::CrystalFF::calcTorsionEnergy(), ForceFields::CrystalFF::calcTorsionEnergyM6(), RDKit::MMFF::constructForceField(), RDKit::MMFF::constructForceField(), RDKit::UFF::constructForceField(), RDKit::UFF::constructForceField(), RDKit::UFF::Tools::getAtomLabel(), RDKit::UFF::getAtomTypes(), ForceFields::CrystalFF::getExperimentalTorsions(), ForceFields::CrystalFF::getExperimentalTorsions(), RDKit::MMFF::DefaultParameters::getMMFFAngle(), RDKit::MMFF::DefaultParameters::getMMFFArom(), RDKit::MMFF::DefaultParameters::getMMFFDef(), RDKit::MMFF::DefaultParameters::getMMFFDfsb(), RDKit::MMFF::DefaultParameters::getMMFFHerschbachLaurie(), RDKit::MMFF::DefaultParameters::getMMFFOop(), RDKit::MMFF::DefaultParameters::getMMFFPBCI(), RDKit::MMFF::DefaultParameters::getMMFFProp(), RDKit::MMFF::DefaultParameters::getMMFFStbn(), RDKit::MMFF::getMMFFStretchBendType(), RDKit::MMFF::DefaultParameters::getMMFFTor(), RDKit::MMFF::getPeriodicTableRow(), RDKit::MMFF::Tools::getTwoBitCell(), RDKit::UFF::Tools::getTwoBitCell(), RDKit::UFF::getUFFAngleBendParams(), RDKit::UFF::getUFFBondStretchParams(), RDKit::UFF::getUFFInversionParams(), RDKit::UFF::getUFFTorsionParams(), RDKit::UFF::getUFFVdWParams(), RDKit::MMFF::isAngleInRingOfSize3or4(), RDKit::MMFF::isAtomInAromaticRingOfSize(), RDKit::MMFF::isAtomNOxide(), RDKit::MMFF::isRingAromatic(), RDKit::MMFF::isTorsionInRingOfSize4or5(), RDKit::MMFF::sanitizeMMFFMol(), RDKit::MMFF::Tools::setTwoBitCell(), RDKit::UFF::Tools::setTwoBitCell(), RDKit::MMFF::Tools::twoBitCellPos(), and RDKit::UFF::Tools::twoBitCellPos().
| #define RDKIT_FRAGCATALOG_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 217 of file export.h.
Referenced by RDKit::findFuncGroupsOnMol(), RDKit::prepareMol(), RDKit::readFuncGroups(), and RDKit::readFuncGroups().
| #define RDKIT_FREESASA_CLIB_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_FREESASALIB_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_GA_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_GENERALIZEDSUBSTRUCT_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 233 of file export.h.
Referenced by RDKit::GeneralizedSubstruct::createExtendedQueryMol(), and RDKit::GeneralizedSubstruct::SubstructMatch().
| #define RDKIT_GENERICGROUPS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 241 of file export.h.
Referenced by RDKit::GenericGroups::Matchers::AcyclicAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::AcyclicHAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::adjustQueryPropertiesWithGenericGroups(), RDKit::GenericGroups::Matchers::AlkenylAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::AlkenylHAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::AlkoxyacyclicAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::AlkoxyacyclicHAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::AlkylAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::AlkylHAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::AlkynylAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::AlkynylHAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::CarboacyclicAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::CarboacyclicHAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::CarboarylAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::CarboarylHAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::CarbocyclicAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::CarbocyclicHAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::CarbocycloalkenylAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::CarbocycloalkenylHAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::CarbocycloalkylAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::CarbocycloalkylHAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::convertGenericQueriesToSubstanceGroups(), RDKit::GenericGroups::Matchers::CyclicAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::CyclicHAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::genericAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::GroupAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::GroupHAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::GroupStarAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::GroupStarHAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::HeteroacyclicAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::HeteroacyclicHAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::HeteroarylAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::HeteroarylHAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::HeterocyclicAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::HeterocyclicHAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::NoCarbonRingAtomMatcher(), RDKit::GenericGroups::Matchers::NoCarbonRingHAtomMatcher(), and RDKit::GenericGroups::setGenericQueriesFromProperties().
| #define RDKIT_GRAPHMOL_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 249 of file export.h.
Referenced by RDKit::Canon::ActivatePartitions(), RDKit::MolOps::details::addExplicitAttachmentPoint(), RDKit::MolOps::addHs(), RDKit::Chirality::addStereoAnnotations(), RDKit::addSubstanceGroup(), RDKit::MolOps::adjustHs(), RDKit::MolOps::adjustQueryProperties(), RDKit::MolOps::adjustQueryProperties(), RDKit::MolOps::assignChiralTypesFrom3D(), RDKit::MolOps::assignChiralTypesFromBondDirs(), RDKit::MolOps::assignChiralTypesFromMolParity(), RDKit::Chirality::assignLegacyCIPLabels(), RDKit::MolOps::assignRadicals(), RDKit::MolOps::assignStereochemistry(), RDKit::MolOps::assignStereochemistryFrom3D(), RDKit::assignStereoGroupIds(), RDKit::MolOps::atomHasConjugatedBond(), RDKit::Canon::canonicalizeEnhancedStereo(), RDKit::Canon::canonicalizeFragment(), RDKit::Canon::chiralAtomNeedsTagInversion(), RDKit::Canon::chiralRankMolAtoms(), RDKit::MolOps::cleanUp(), RDKit::MolOps::cleanupAtropisomers(), RDKit::MolOps::cleanupAtropisomers(), RDKit::Atropisomers::cleanupAtropisomerStereoGroups(), RDKit::MolOps::cleanupChirality(), RDKit::MolOps::cleanUpOrganometallics(), RDKit::Chirality::cleanupStereoGroups(), RDKit::MolOps::clearAllBondDirFlags(), RDKit::MolOps::clearDirFlags(), RDKit::Chirality::clearMolBlockWedgingInfo(), RDKit::MolOps::clearSingleBondDirFlags(), RDKit::MolOps::collapseAttachmentPoints(), RDKit::QueryOps::completeMolQueries(), RDKit::convertComplexNameToQuery(), RingUtils::convertToBonds(), RDKit::copyMolSubset(), RDKit::copyMolSubset(), RDKit::copyMolSubset(), RDKit::MolOps::countAtomElec(), RDKit::Chirality::detail::countChiralNbrs(), RDKit::Canon::CreateSinglePartition(), RDKit::MolOps::dativeBondsToHaptic(), RDKit::MolOps::dativeBondsToHaptic(), RDKit::Atropisomers::detectAtropisomerChirality(), RDKit::MolOps::detectBondStereochemistry(), RDKit::Chirality::detail::determineBondWedgeState(), RDKit::Chirality::detail::determineBondWedgeState(), RDKit::Atropisomers::doesMolHaveAtropisomers(), RDKit::MolOps::expandAttachmentPoints(), 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| #define RDKIT_HC_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_INCHI_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_INFOTHEORY_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_MAEPARSER_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_MARVINPARSER_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 281 of file export.h.
Referenced by RDKit::ChemicalReactionToMrvBlock(), RDKit::ChemicalReactionToMrvFile(), RDKit::v2::MarvinParser::MolFromMrvBlock(), RDKit::v2::MarvinParser::MolFromMrvDataStream(), RDKit::v2::MarvinParser::MolFromMrvFile(), RDKit::MolToMrvBlock(), RDKit::MolToMrvFile(), RDKit::v2::MarvinParser::MrvBlockIsReaction(), RDKit::v2::MarvinParser::MrvDataStreamIsReaction(), RDKit::v2::MarvinParser::MrvFileIsReaction(), RDKit::v2::MarvinParser::ReactionFromMrvDataStream(), and RDKit::v2::MarvinParser::ReactionFromMrvFile().
| #define RDKIT_MMPA_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 273 of file export.h.
Referenced by RDKit::MMPA::detail::computeMorganCodeHash(), RDKit::MMPA::fragmentMol(), RDKit::MMPA::fragmentMol(), and RDKit::MMPA::fragmentMol().
| #define RDKIT_MOLALIGN_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 289 of file export.h.
Referenced by RDKit::MolAlign::alignMol(), RDKit::MolAlign::alignMolConformers(), RDKit::MolAlign::CalcRMS(), RDKit::MolAlign::CalcRMS(), RDKit::MolAlign::getAlignmentTransform(), RDKit::MolAlign::getAllConformerBestRMS(), RDKit::MolAlign::getBestAlignmentTransform(), RDKit::MolAlign::getBestRMS(), RDKit::MolAlign::getO3AForProbeConfs(), RDKit::MolAlign::o3aCrippenCostFunc(), RDKit::MolAlign::o3aCrippenScoringFunc(), RDKit::MolAlign::o3aCrippenWeightFunc(), RDKit::MolAlign::o3aMMFFCostFunc(), RDKit::MolAlign::o3aMMFFScoringFunc(), RDKit::MolAlign::o3aMMFFWeightFunc(), RDKit::MolAlign::randomTransform(), RDKit::MolAlign::reflect(), and RDKit::MolAlign::details::symmetrizeTerminalAtoms().
| #define RDKIT_MOLCATALOG_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_MOLCHEMICALFEATURES_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 305 of file export.h.
Referenced by RDKit::buildFeatureFactory(), RDKit::buildFeatureFactory(), RDKit::Local::parseAtomType(), RDKit::parseFeatureData(), RDKit::parseFeatureData(), RDKit::Local::parseFeatureDef(), and RDKit::parseFeatureFile().
| #define RDKIT_MOLDRAW2D_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 313 of file export.h.
Referenced by RDKit::MolDraw2D_detail::addAtomIndices(), RDKit::MolDraw2D_detail::addBondIndices(), RDKit::MolDraw2D_detail::adjustLineEndForEllipse(), RDKit::MolDraw2D_detail::arcPoints(), RDKit::MolDraw2D_detail::calcArrowHead(), RDKit::MolDraw2DUtils::contourAndDrawGaussians(), RDKit::MolDraw2DUtils::contourAndDrawGaussians(), RDKit::MolDraw2DUtils::contourAndDrawGrid(), RDKit::MolDraw2DUtils::contourAndDrawGrid(), RDKit::MolDraw2D_detail::doesLineIntersect(), RDKit::MolDraw2D_detail::doesLineIntersectArc(), RDKit::MolDraw2D_detail::doesLineIntersectEllipse(), RDKit::MolDraw2D_detail::doesTriangleIntersect(), RDKit::MolDraw2D_detail::doLinesIntersect(), RDKit::MolDraw2DUtils::drawMolACS1996(), RDKit::MolDraw2D_detail::getBracketPoints(), RDKit::MolDraw2D_detail::handdrawnLine(), RDKit::MolDraw2D_detail::isPointInTriangle(), RDKit::MolDraw2DUtils::meanBondLength(), RDKit::MolDraw2DUtils::prepareAndDrawMolecule(), RDKit::MolDraw2DUtils::prepareMolForDrawing(), RDKit::MolDraw2DUtils::setACS1996Options(), RDKit::MolDraw2D_detail::setStringDrawMode(), RDKit::MolDraw2DUtils::updateDrawerParamsFromJSON(), RDKit::MolDraw2DUtils::updateDrawerParamsFromJSON(), RDKit::MolDraw2DUtils::updateMolDrawOptionsFromJSON(), and RDKit::MolDraw2DUtils::updateMolDrawOptionsFromJSON().
| #define RDKIT_MOLDRAW2DQT_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_MOLENUMERATOR_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 329 of file export.h.
Referenced by RDKit::MolEnumerator::enumerate().
| #define RDKIT_MOLHASH_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 337 of file export.h.
Referenced by RDKit::MolHash::MolHash(), RDKit::MolHash::SplitMolecule(), and RDKit::MolHash::Strip().
| #define RDKIT_MOLINTERACTIONFIELDS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 345 of file export.h.
Referenced by RDMIF::readFromCubeStream(), RDMIF::writeToCubeFile(), and RDMIF::writeToCubeStream().
| #define RDKIT_MOLINTERCHANGE_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 353 of file export.h.
Referenced by RDKit::MolInterchange::JSONDataStreamToMols(), and RDKit::MolInterchange::MolsToJSONData().
| #define RDKIT_MOLPROCESSING_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_MOLSTANDARDIZE_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 369 of file export.h.
Referenced by RDKit::MolStandardize::canonicalTautomer(), RDKit::MolStandardize::canonicalTautomerInPlace(), RDKit::MolStandardize::chargeParent(), RDKit::MolStandardize::chargeParentInPlace(), RDKit::MolStandardize::chargeParentInPlace(), RDKit::MolStandardize::cleanup(), RDKit::MolStandardize::Operations::cleanup2D(), RDKit::MolStandardize::cleanupInPlace(), RDKit::MolStandardize::cleanupInPlace(), RDKit::MolStandardize::disconnectOrganometallics(), RDKit::MolStandardize::disconnectOrganometallics(), RDKit::MolStandardize::enumerateTautomerSmiles(), RDKit::MolStandardize::fragmentParent(), RDKit::MolStandardize::fragmentParentInPlace(), RDKit::MolStandardize::fragmentParentInPlace(), RDKit::MolStandardize::isotopeParent(), RDKit::MolStandardize::isotopeParentInPlace(), RDKit::MolStandardize::isotopeParentInPlace(), RDKit::MolStandardize::Operations::makeParent(), RDKit::MolStandardize::normalize(), RDKit::MolStandardize::normalizeInPlace(), RDKit::MolStandardize::normalizeInPlace(), RDKit::MolStandardize::Operations::parse(), RDKit::MolStandardize::Operations::prepareForStandardization(), RDKit::MolStandardize::Operations::prepareForValidation(), RDKit::MolStandardize::readFuncGroups(), RDKit::MolStandardize::readFuncGroups(), RDKit::MolStandardize::readFuncGroups(), RDKit::MolStandardize::readPairs(), RDKit::MolStandardize::readPairs(), RDKit::MolStandardize::readTautomers(), RDKit::MolStandardize::readTautomers(), RDKit::MolStandardize::readTautomers(), RDKit::MolStandardize::readTransformations(), RDKit::MolStandardize::readTransformations(), RDKit::MolStandardize::Operations::reapplyWedging(), RDKit::MolStandardize::reionize(), RDKit::MolStandardize::reionizeInPlace(), RDKit::MolStandardize::reionizeInPlace(), RDKit::MolStandardize::removeFragments(), RDKit::MolStandardize::removeFragmentsInPlace(), RDKit::MolStandardize::removeFragmentsInPlace(), RDKit::MolStandardize::TautomerScoringFunctions::scoreHeteroHs(), RDKit::MolStandardize::TautomerScoringFunctions::scoreRings(), RDKit::MolStandardize::TautomerScoringFunctions::scoreSubstructs(), RDKit::MolStandardize::Operations::serialize(), RDKit::MolStandardize::Operations::standardize(), RDKit::MolStandardize::standardizeSmiles(), RDKit::MolStandardize::stereoParent(), RDKit::MolStandardize::stereoParentInPlace(), RDKit::MolStandardize::stereoParentInPlace(), RDKit::MolStandardize::stringToBondType(), RDKit::MolStandardize::stringToCharge(), RDKit::MolStandardize::superParent(), RDKit::MolStandardize::superParentInPlace(), RDKit::MolStandardize::superParentInPlace(), RDKit::MolStandardize::tautomerParent(), RDKit::MolStandardize::tautomerParentInPlace(), RDKit::MolStandardize::tautomerParentInPlace(), RDKit::MolStandardize::updateCleanupParamsFromJSON(), RDKit::MolStandardize::Operations::validate(), and RDKit::MolStandardize::validateSmiles().
| #define RDKIT_MOLTRANSFORMS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 377 of file export.h.
Referenced by MolTransforms::canonicalizeConformer(), MolTransforms::canonicalizeMol(), MolTransforms::computeCanonicalTransform(), MolTransforms::computeCentroid(), MolTransforms::getAngleRad(), MolTransforms::getBondLength(), MolTransforms::getDihedralRad(), MolTransforms::setAngleRad(), MolTransforms::setBondLength(), MolTransforms::setDihedralRad(), MolTransforms::transformAtom(), MolTransforms::transformConformer(), MolTransforms::transformMolsAtoms(), and MolTransforms::transformMolSubstanceGroups().
| #define RDKIT_O3AALIGN_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_OPTIMIZER_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_PARTIALCHARGES_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 401 of file export.h.
Referenced by RDKit::computeGasteigerCharges(), RDKit::computeGasteigerCharges(), and RDKit::computeGasteigerCharges().
| #define RDKIT_PUBCHEM_ALIGN3D_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_PUBCHEMSHAPE_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_QUERY_EXPORT RDKIT_GRAPHMOL_EXPORT |
| #define RDKIT_RASCALMCES_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 481 of file export.h.
Referenced by RDKit::RascalMCES::details::cleanSmarts(), RDKit::RascalMCES::details::extractClique(), RDKit::RascalMCES::details::getBondLabels(), RDKit::RascalMCES::details::johnsonSimilarity(), RDKit::RascalMCES::details::printAtomMatches(), RDKit::RascalMCES::details::printBondMatches(), RDKit::RascalMCES::details::printScores(), RDKit::RascalMCES::rascalCluster(), RDKit::RascalMCES::rascalMCES(), RDKit::RascalMCES::details::resultCompare(), RDKit::RascalMCES::details::tier1Sim(), and RDKit::RascalMCES::details::tier2Sim().
| #define RDKIT_RDBOOST_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_RDCHEMDRAWLIB_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_RDCHEMDRAWREACTIONLIB_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_RDGENERAL_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 441 of file export.h.
Referenced by RDKit::augmentTagName(), RDKit::computeIntVectPrimesProduct(), boost::logging::disable_logs(), boost::logging::disable_logs(), boost::logging::enable_logs(), boost::logging::enable_logs(), RDKit::feq(), RDKit::getDoubleRandomSource(), RDKit::getRandomGenerator(), RDKit::getRandomVal(), RDLog::InitLogs(), RDKit::Intersect(), boost::logging::log_status(), RDKit::nextCombination(), Invar::operator<<(), RDLog::toStream(), RDKit::Union(), and RDKit::Union().
| #define RDKIT_RDGEOMETRYLIB_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 449 of file export.h.
Referenced by RDGeom::computeDihedralAngle(), RDGeom::computeSignedDihedralAngle(), RDGeom::findGridTerminalPoints(), RDGeom::operator&(), operator*(), operator*(), operator*(), RDGeom::operator*(), RDGeom::operator*(), RDGeom::operator*(), RDGeom::operator+(), RDGeom::operator+(), RDGeom::operator+(), RDGeom::operator+(), RDGeom::operator-(), RDGeom::operator-(), RDGeom::operator-(), RDGeom::operator-(), RDGeom::operator/(), RDGeom::operator/(), RDGeom::operator/(), RDGeom::operator<<(), RDGeom::operator|(), RDGeom::protrudeDistance(), RDGeom::tanimotoDistance(), RDGeom::tverskyIndex(), RDGeom::writeGridToFile(), and RDGeom::writeGridToStream().
| #define RDKIT_RDINCHILIB_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_RDSTREAMS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_REDUCEDGRAPHS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 489 of file export.h.
Referenced by RDKit::ReducedGraphs::generateMolExtendedReducedGraph(), and RDKit::ReducedGraphs::getErGFingerprint().
| #define RDKIT_RGROUPDECOMPOSITION_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 473 of file export.h.
Referenced by RDKit::fingerprintVarianceScore(), RDKit::relabelMappedDummies(), RDKit::RGroupDecompose(), RDKit::RGroupDecompose(), RDKit::toJSON(), RDKit::toJSON(), RDKit::toJSON(), RDKit::toJSON(), and RDKit::updateRGroupDecompositionParametersFromJSON().
| #define RDKIT_RINGDECOMPOSERLIB_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
| #define RDKIT_SCAFFOLDNETWORK_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 513 of file export.h.
Referenced by RDKit::ScaffoldNetwork::detail::addMolToNetwork(), RDKit::ScaffoldNetwork::detail::flattenMol(), RDKit::ScaffoldNetwork::getBRICSNetworkParams(), RDKit::ScaffoldNetwork::detail::makeScaffoldGeneric(), RDKit::ScaffoldNetwork::detail::pruneMol(), and RDKit::ScaffoldNetwork::detail::removeAttachmentPoints().
| #define RDKIT_SHAPEHELPERS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 521 of file export.h.
Referenced by RDKit::MolShapes::computeConfBox(), RDKit::MolShapes::computeConfDimsAndOffset(), RDKit::MolShapes::computeUnionBox(), RDKit::MolShapes::EncodeShape(), RDKit::MolShapes::EncodeShape(), RDKit::MolShapes::getConfDimensions(), RDKit::MolShapes::protrudeDistance(), RDKit::MolShapes::protrudeDistance(), RDKit::MolShapes::tanimotoDistance(), RDKit::MolShapes::tanimotoDistance(), RDKit::MolShapes::tverskyIndex(), and RDKit::MolShapes::tverskyIndex().
| #define RDKIT_SIMDIVPICKERS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 529 of file export.h.
Referenced by RDPickers::getDistFromLTM().
| #define RDKIT_SLNPARSE_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 505 of file export.h.
Referenced by RDKit::SLNParse::finalizeQueryMol(), RDKit::SLNQueryToMol(), and RDKit::SLNToMol().
| #define RDKIT_SMILESPARSE_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 537 of file export.h.
Referenced by SmilesParseOps::AddFragToMol(), SmilesParseOps::AdjustAtomChiralityFlags(), RDKit::v2::SmilesParse::AtomFromSmarts(), RDKit::v2::SmilesParse::AtomFromSmiles(), RDKit::v2::SmilesParse::BondFromSmarts(), RDKit::v2::SmilesParse::BondFromSmiles(), RDKit::canonicalizeStereoGroups(), SmilesParseOps::CheckChiralitySpecifications(), SmilesParseOps::checkChiralPermutation(), SmilesParseOps::CheckRingClosureBranchStatus(), SmilesParseOps::CleanupAfterParseError(), SmilesParseOps::CleanupAfterParsing(), SmilesParseOps::ClearAtomChemicalProps(), SmilesParseOps::CloseMolRings(), RDKit::SmartsWrite::GetAtomSmarts(), RDKit::SmilesWrite::GetAtomSmiles(), RDKit::SmartsWrite::GetBondSmarts(), RDKit::SmilesWrite::GetBondSmiles(), RDKit::SmilesWrite::getCXExtensions(), RDKit::SmilesWrite::getCXExtensions(), SmilesParseOps::GetUnspecifiedBondType(), SmilesParseOps::getUnspecifiedQueryBond(), RDKit::SmilesWrite::inOrganicSubset(), RDKit::MolFragmentToCXSmarts(), RDKit::MolFragmentToCXSmiles(), RDKit::MolFragmentToSmarts(), RDKit::MolFragmentToSmiles(), RDKit::v2::SmilesParse::MolFromSmarts(), RDKit::v2::SmilesParse::MolFromSmiles(), RDKit::MolToCXSmarts(), RDKit::MolToCXSmiles(), RDKit::MolToRandomSmilesVect(), RDKit::MolToSmarts(), RDKit::MolToSmiles(), RDKit::SmilesWrite::detail::MolToSmiles(), SmilesParseOps::parseCXExtensions(), SmilesParseOps::ReportParseError(), SmilesParseOps::SetUnspecifiedBondTypes(), RDKit::updateCXSmilesFieldsFromJSON(), RDKit::updateCXSmilesFieldsFromJSON(), RDKit::updateSmilesWriteParamsFromJSON(), and RDKit::updateSmilesWriteParamsFromJSON().
| #define RDKIT_STRUCTCHECKER_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 545 of file export.h.
Referenced by RDKit::StructureCheck::AAMatch(), RDKit::StructureCheck::AddMWMF(), RDKit::StructureCheck::AtomClash(), RDKit::StructureCheck::AtomParity(), RDKit::StructureCheck::AtomSymbolMatch(), RDKit::StructureCheck::CheckAtoms(), RDKit::StructureCheck::CheckStereo(), RDKit::StructureCheck::CisTransPerception(), RDKit::StructureCheck::convertBondType(), RDKit::StructureCheck::DubiousStereochemistry(), RDKit::StructureCheck::FixDubious3DMolecule(), RDKit::StructureCheck::getAtomicNumber(), RDKit::StructureCheck::getMolAtomPoints(), RDKit::StructureCheck::isBondTypeMatch(), RDKit::StructureCheck::LigandMatches(), RDKit::StructureCheck::loadOptionsFromFiles(), RDKit::StructureCheck::LogNeighbourhood(), RDKit::StructureCheck::parseOptionsJSON(), RDKit::StructureCheck::RecMatch(), RDKit::StructureCheck::RemoveDubiousStereochemistry(), RDKit::StructureCheck::SetupNeighbourhood(), RDKit::StructureCheck::StringToAugmentedAtom(), RDKit::StructureCheck::StripSmallFragments(), and RDKit::StructureCheck::TransformAugmentedAtoms().
| #define RDKIT_SUBGRAPHS_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 553 of file export.h.
Referenced by RDKit::Subgraphs::bondListFromAtomList(), RDKit::Subgraphs::calcPathDiscriminators(), RDKit::findAllPathsOfLengthN(), RDKit::findAllPathsOfLengthsMtoN(), RDKit::findAllSubgraphsOfLengthsMtoN(), RDKit::findAtomEnvironmentOfRadiusN(), RDKit::findUniqueSubgraphsOfLengthN(), RDKit::Subgraphs::pathToSubmol(), RDKit::Subgraphs::pathToSubmol(), and RDKit::Subgraphs::uniquifyPaths().
| #define RDKIT_SUBSTRUCTLIBRARY_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 561 of file export.h.
Referenced by RDKit::addPatterns(), RDKit::addPatterns(), and RDKit::SubstructLibraryCanSerialize().
| #define RDKIT_SUBSTRUCTMATCH_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 569 of file export.h.
Referenced by RDKit::atomCompat(), RDKit::bondCompat(), RDKit::chiralAtomCompat(), RDKit::getMostSubstitutedCoreMatch(), RDKit::isAtomTerminalRGroupOrQueryHydrogen(), RDKit::propertyCompat(), RDKit::removeDuplicates(), RDKit::SubstructMatch(), RDKit::SubstructMatch(), RDKit::SubstructMatch(), RDKit::SubstructMatch(), RDKit::SubstructMatch(), RDKit::substructMatchParamsToJSON(), RDKit::toPrime(), and RDKit::updateSubstructMatchParamsFromJSON().
| #define RDKIT_SYNTHONSPACESEARCH_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 577 of file export.h.
Referenced by RDKit::SynthonSpaceSearch::details::bitSetsToVectors(), RDKit::SynthonSpaceSearch::details::buildConnRegion(), RDKit::SynthonSpaceSearch::details::buildProduct(), RDKit::SynthonSpaceSearch::details::buildProductName(), RDKit::SynthonSpaceSearch::details::buildProductName(), RDKit::SynthonSpaceSearch::details::checkTimeOut(), RDKit::SynthonSpaceSearch::details::combMFromN(), RDKit::SynthonSpaceSearch::convertTextToDBFile(), RDKit::SynthonSpaceSearch::details::countChiralAtoms(), RDKit::SynthonSpaceSearch::details::countConnections(), RDKit::SynthonSpaceSearch::details::expandBitSet(), RDKit::SynthonSpaceSearch::formattedIntegerString(), RDKit::SynthonSpaceSearch::details::getConnectorPattern(), RDKit::SynthonSpaceSearch::details::getConnectorPermutations(), RDKit::SynthonSpaceSearch::details::permMFromN(), and RDKit::SynthonSpaceSearch::details::removeQueryAtoms().
| #define RDKIT_TAUTOMERQUERY_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 585 of file export.h.
Referenced by RDKit::SubstructMatch(), and RDKit::TautomerQueryCanSerialize().
| #define RDKIT_TRAJECTORY_EXPORT RDKIT_IMPORT_API |
Definition at line 593 of file export.h.
Referenced by RDKit::readAmberTrajectory(), and RDKit::readGromosTrajectory().
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